アサシンのクリードシャドウズにより、プレイヤーは2人の主人公を選択できます:ナエ、女性忍、歴史的なアフリカのサムライのヤスケ。この選択は、単一のキャラクターに焦点を当てることにより、潜在的に欠落しているコンテンツを心配しているファンの間で議論を生み出しました。
クリエイティブディレクターのジョナサンデュモンは、1人の主人公に優先順位を付けることは自分の経験に大きな影響を与えないことをプレイヤーに保証します。各キャラクターはユニークなオープニングシーケンスと個人的なストーリーラインを誇っていますが、ゲームの物語はプレイヤーの選択に適応します。 Dumont自身は両方のキャラクターを演奏し、多くの場合、一度に数時間それらを切り替えます。しかし、彼はプレイヤーが、重要なストーリー要素やゲームプレイを見逃すことを恐れることなく、好みの主人公に自由に集中できることを強調しています。各ヒーローには独自の紹介と献身的なクエストがありますが、コアエクスペリエンスは柔軟です。